300 tahun setelah becana peperangan usai.
Kekuasaan yang memerintah Bumi yaituSphere telah digulingkan, memberikankan jalan bagi penguasa baru di dunia baru. Sementara itu, jauh di Mars, bunga api yang memicu ancaman perang baru telah menerjang ….
Tokoh utama yaitu Mikazuki Augus, anggota dari satuan keamanan khusus Chryse Guard Security (CGS), mengambil misi sebagai pengawal dari Kudelia Aina Bernstein, seorang gadis muda yang menggerakkan kemerdekaan Chryse dari Bumi. Namun, ketika unit elit Gjallarhorn memberikan tekanan revolusioner, menyergap CGS, para petinggi sengaja menggunakan Mikazuki dan anak-anak lainnya sebagai umpan untuk menutupi kemunduran mereka. Orga Itsuka, pemimpin skuad anak laki-laki ‘, mengambil mengambil kemunduran ini sebagai motivasi untuk meluncurkan kudeta penuh. Dengan perintah dari Orga untuk menahan unit elit Gjallarhorn, Mikazuki menyerang di era Bencana Perang dengan generator yang pernah digunakan CGS, Gundam Barbatos ….